擁有1.8億人口的巴基斯坦地處南亞，國土面積79萬多平方公里，東邊印度比鄰，邊界長2240公里，南面是阿拉伯海，西與伊朗接壤，邊境長900多公里，西北和阿富汗相連，兩國邊境長2560公里，東北面與中國新疆接壤。
特殊的地理環境，以及歷史和部落統治等復雜原因，使巴基斯坦反恐處于“敵友難分”尷尬境地。漫長的巴基斯坦阿富汗邊界可以說有邊無防，兩國只在一些重要的邊境地段建有隔離網，絕大多數地段連標示都沒有。
由于財力軍力有限，巴基斯坦在管理邊境僅靠900多軍事哨卡和巡邏部隊，邊境地區很多村子，一半在巴基斯坦，一半在阿富汗，兩國邊境地區的人都是普什圖族，同祖、同文、同信仰、同習俗，對恐怖分子的滲透活動防不勝防。恐怖分子上午在巴基斯坦進行恐怖爆炸后，下午就逃回阿富汗。為此，巴基斯坦軍方時常不得不跨境，追剿恐怖分子。
巴基斯坦通訊社記者阿勒亞說，巴基斯坦的恐怖爆炸次數量呈一個山形，2009年達到高點，然后開始明顯下降，原因是巴基斯坦反恐行動取得顯著的效果，巴基斯坦民眾對恐怖組織濫殺無辜，由人人自危轉向越來越厭惡，舉報也越來越多。阿勒亞還說，恐怖分子也變得越來越狡猾，調整襲擊目標，現在主要鎖定在中小城鎮的政府部門，尤其是非正規軍部門和警察局。他認為，貧困和無知是恐怖和罪惡之源，巴基斯坦必須發展經濟和教育。
目前，巴基斯坦反恐主要采用3D戰略。第一、Dialogue(對話)，即通過對話，讓塔利班放下武器，保證不再從事恐怖活動，政府既往不咎；第二、Deterrence(威懾),即如果塔利班部隊不接受政府的領導，就堅決剿滅；第三、Development(發展),即在受塔利班影響的地區，建設基礎設施、學校和醫院，搞活經濟，發展民生。
在過去近10年里，巴基斯坦對以基地組織和塔利班進行了1700多次不同規模的軍事打擊，擊斃和抓獲17742名恐怖分子，使恐怖爆炸活動從2009年下半年開始下降，巴基斯坦民眾恢復對政府和軍隊的信心。
