日本與菲律賓兩國政府9日舉行了有關亞洲地區海洋安全問題的首次副司局級磋商，如何應對中國在東海和南海海域主權主張成為本次磋商的一個主要議題。在南海和東海局勢錯綜復雜的情況下，日菲兩國舉辦這樣的政府間磋商，引起較大關注。分析人士認為，日菲兩國在對華海洋權益談判中各有所圖，期望通過聯手互動，對抗中國，以謀求其自身利益的最大化。

據日本媒體報道，日菲兩國并未掩蓋此次磋商的目的。中國與菲律賓之間就南沙群島主權問題存在爭議，而南海對于日本而言也是重要的海上通道，在東海問題上，中日兩國因為釣魚島問題也摩擦不斷。為應對中國加強對東海和南海海域的主權訴求，日菲兩國將定期舉行政府間磋商，協調行動，推進合作，并確保日本在南海海域的航行自由和船只安全。此外，雙方還就攜手應對馬六甲海峽和索馬里海域的海盜問題達成了一致。日菲兩國對于此次磋商均給予了較高重視，日本派出外務省、防衛省、海上保安廳等部門的負責人出席，菲律賓則派出其海洋主管部門海岸警備隊的有關官員參加了磋商。

日本近年來對南海海域關注度大增，頻頻出手南海事務。日本海上自衛隊7月曾聯手美國和澳大利亞兩國在文萊附近的南海海域舉行了首次聯合軍事訓練，在中國和南海海域附近一些國家因為領海問題出現爭端的情況下，三國此舉被認為是明顯為了牽制中國，形成對華軍事行動和輿論打壓的包圍圈。

日菲兩國之間具有著廣泛的政治經濟聯系和合作，人員往來頻繁。現在，日本已超過中國大陸，成為菲律賓最大的出口對象國和進口對象國，據菲律賓國家統計局公布的2010年海外各國對菲律賓直接投資統計顯示，日本對菲直接投資所占比重為29.8%，遠遠超過其他國家。經濟方面密切如此，兩國間的政治互動也十分緊密，菲律賓總統阿基諾三世在8月秘密訪日期間，曾在日本政府的斡旋下，首次會晤了菲反政府武裝的最高領導人，日本對菲的政治影響力由此可見一斑。另據日本有關方面的統計，目前工作和生活在日本的菲律賓人已經超過22萬人。日菲兩國之間沒有領土和歷史問題等方面懸而未決的爭端，在這種背景下，雙方加強聯系和交往就顯得順暢了許多。