隨著戰事發展，兩軍統一指揮的問題漸漸提到議事日程上。在第一次戰役期間，彭德懷屢次報告，因中朝之間缺乏協調——語言不通、地形不熟、朝鮮黨政軍民撤退堵塞道路等等，“志愿軍行軍作戰受阻”。特別是還多次發生人民軍誤擊志愿軍的事件。如11月 4日志愿軍第39軍在博川東南圍攻美第24師時，遭到奉命向順川挺進的人民軍坦克師的誤擊，致使被圍之敵逃脫。在物資供給、交通運輸等方面，由于沒有統一的協調指揮，也出現了混亂的局面。

為此，彭德懷通過北京委托中國使館人員向金日成提出作戰中的協調統一問題，希望人民軍總部能夠靠近志愿軍總部。11月7日彭又請樸一禹面見金日成，反映幾個問題。但商談3天的結果令人失望：1、開辟敵后戰場問題，由于什特科夫堅決支持中國方面的主張，決定派方虎山和崔仁兩個軍團深入敵后，金日成對此勉強同意。2、兩軍配合問題，金日成堅持只派參謀擔任通信聯絡，交換情報，既不同意兩軍總部靠近，更不同意采取聯合的形式。3、朝鮮嚴重虐待俘虜，甚至殃及英、美使館人員的問題，彭德壞對此婉轉地提出了意見，金日成收下彭介紹中國戰俘政策的親筆信后，未置可否。4、對待逃避兵役的朝鮮平民問題，金日成同意志愿軍幫助召回逃跑者，但實際上準備以反叛罪名對這些人進行武裝圍剿。在此期間，彭請求中央軍委轉告金日成，人民軍第6師尚有6200多人，且已同志愿軍125師會合，希望讓該師留在當地協同志愿軍作戰。但金堅持將該師調走了。后第7師5000余人又與125師會合，彭再次提出留下該師，金日成則不予答復。此外，朝方和駐朝蘇聯軍事顧問還反對彭德懷提出的后撤幾十公里設伏的第二次戰役作戰方針，主張志愿軍應繼續向清川江以南追擊敵人。

所有這些問題的核心是軍隊指揮權的歸屬。為了解決問題，毛澤東決定一方面請中朝兩軍最高指揮官直接面談，協調雙方立場，一方面向莫斯科反映意見，以求得到支持。

11月15日，金日成和什特科夫應邀來到志愿軍總部，高崗也專程從沈陽趕到。會談一開始，性情直率的彭德懷便提出了兩軍必須統一指揮的問題。高崗也解釋說，朝鮮半島地域狹窄，戰役上沒有統一指揮不行。什特科夫明確表示應該由中方統一指揮，并批評人民軍以最好的蘇聯裝備打了敗仗，而贊揚志愿軍以劣勢裝備消滅了大量敵軍，認為對中方指揮的正確性不應存在任何懷疑。但金日成在發言中只介紹了人民軍的情況，而對指揮權和有關政策問題卻閉口不談。情急之下，彭直接提出了自己設想的方案，即由金、什特科夫和他本人組成一個三人小組，負責對軍事問題進行協商和統一指揮。對此建議，金日成未置可否，什特科夫因未請示莫斯科，也不便表態。最后決定，待第二次戰役結束后召開會議再行討論。