這些經費除駐京辦工作人員工資、福利開支外，其中不少是用于“公關”所產生的費用，或是用于地方官員來京接待的開銷。由于財政管理漏洞多，駐京辦主任對經費有絕對的支配權，腐敗由此而生。

駐京辦不僅有數量龐雜的問題，其內部權責不清，以及監督管理體制不健全，是造成駐京辦腐敗問題的最重要原因。

大陸學者認為，國務院的國管局、派出地和北京市對駐京辦的管理職責要明晰，監管要到位，才能避免管理出現真空。然而要“加強預算、財務和資產管理，將駐京辦事機構國有資產收益及其它非稅收入納入派出地財政管理，每年對駐京辦事機構進行審計，并不得違規使用財政資金在北京新建和購置具有經營、接待服務性質的場所”，卻不容易。

現在既決定撤銷駐京辦，接下來的問題是，目前駐京辦扮演的角色職能，由誰來承接？

“駐京辦問題遠非一撤了事那么簡單。原有數千家駐京辦肩負的溝通聯系、接待服務、信息匯總等職能存在客觀需求，需另辟管道加以滿足。”大陸的國家行政學院政治學教研部副主任龔維斌說，“如果一些根本性問題沒有解決，它還會以各種形式長期隱性存在”。(王超群)