紀檢、檢察機關部分調查人員和一些學者認為，制度缺陷和監管缺位是郝鵬俊案的根源所在。

違規審批、入股辦礦、挪用煤炭基金……隨著煤焦領域成為山西紀檢部門查處重點，因煤而生的各種腐敗問題逐漸浮出水面。山西省紀委曾于2010年1月21日通報稱，該省在2009年展開的煤焦領域反腐敗專項斗爭中，共清繳違規違紀資金145.82億元，處理了1217名違紀黨員干部。

山西財經大學法學院教授田肇樹認為，制約機制不健全是“官煤”式腐敗的溫床。一些“一把手”的個人意志膨脹，加上他們控制著相當大的物資分配權、人事管理權和項目審批權等，腐敗很容易滋生。

一位紀檢部門工作人員分析說，以郝鵬俊案件為例，他自恃“一把手”，在單位大權獨攬，有恃無恐，驕橫跋扈。制度卻不健全，配套措施不完善，執行不堅決，使制度形同虛設。

蒲縣煤炭局太林煤管站站長郭敬銘說，他有時去成南嶺煤礦監管提意見，局長說你不用管，這都沒有問題，咱一直都是按國家規定來干的。

另一方面，對以煤焦領域為代表的基層官員監管缺位、監督無力，被認為是小官員、大腐敗的重要因素。

一位辦案人員認為，郝鵬俊在長期違紀違法過程中，群眾的反映舉報很多，但卻得不到及時查處，究其原因是郝鵬俊與某些領導有著千絲萬縷的聯系，出了問題會有各方面的人出面說情，甚至干擾調查，對案件偵查設置障礙。在這些“背景”的庇護下，郝鵬俊可以有恃無恐地干違法犯罪的事。