長期以來，閩臺兩地迥異的時空環境，提供了歌仔戲藝術不同的成長養分，使得兩岸歌仔戲在各自的成長過程中，逐漸出現一“同中有異，異中有同”的人文意識和藝術特性，在舞臺上呈現出各具情趣的表現風格，這樣一來，便也提供了可以彼此觀摩借鑒的對話空間。臺灣大學中文系教授曾永義認為，兩岸歌仔戲應該互相取長補短，臺灣歌仔戲在精致化、講究結構的賢湊性、每出戲排場的新穎變化方面有優勢，但是，臺灣的精致歌仔戲之所以能夠如此，是因為受到祖國大陸專業戲劇工作人員的影響，是交流形成的非常重要的結果。曾永義說；“我在臺灣說過，要說真正的歌仔戲的韻味，還是在漳州。”所以，我覺得兩岸的共通對閩南文化的提升有意義。

臺灣歌仔戲表演藝術家廖瓊枝通過唱腔形象地說明了兩岸歌仔戲的差異，她對比了兩岸“七字調”的不同唱法后說“我們發現大陸這邊的唱法驚訝的情緒表現得比較好，后來碰到適合的場面，就學這邊的唱法。另外，大陸這邊水袖的花樣很多，我們也吸收過來。過去，我們一直認為只有雜技中才用，沒想到歌仔戲也可以用。”

歌仔戲有著來自民間的質樸美感和細膩表達，有著豐富而活潑的音樂結構以及貼近民間的草根情感。歌仔戲體現著兩岸血淵源，歌仔戲的命運與閩臺民眾的生活息息相關。走過百年歷史的歌仔戲，在新世紀該如何保持它的生命力呢？兩岸專家、學者和業界人士都提出了不少有創意的見解。