福建省第十三屆運動會于2006年10月23日至10月30日在閩西龍巖舉辦。

全省9個設區市、12個行業系統代表團組隊參加了本次運動會。在本屆省運會中，青少年部共決出金牌515枚，行業部共決出金牌84枚。包括奧運會、全運會和年度帶牌帶分計算在內，各個代表團重新排定了座次。

青少年部（地市組）金牌總數排名依次為：福州、廈門、泉州、龍巖、漳州、莆田、三明、寧德、南平；團體總分的排名依次為：福州、廈門、泉州、漳州、龍巖、莆田、三明、南平、寧德。

行業部的團體總分排名前六的是：高校、建設、衛生、前衛、地稅、郵政；金牌數排名前六的是：高校、建設、衛生、郵政、前衛、地稅。