有許多人好奇于達芬奇對這幅作品表現出的厚愛。一些人相信癥結就在“畫中人”身上。《蒙娜麗莎》曾經被猜測是意大利某位名叫“伊莎貝拉”的妓女的畫像（因此笑帶譏誚），或是某個深得達芬奇傾心的愛人的容貌（所以眼含深情）。一些學者通過“蒙娜·麗莎”這個大名讀出了“雌雄同體”的暗示，進而猜測她的微笑屬于某個年輕男子，又或者，就像美國作家丹·布朗在小說《達芬奇密碼》中宣稱的那樣，更多人相信它其實是畫家的自畫像。

歷史學者們從未停止過他們的猜測。而利用現代科技，得到答案并沒那么難。意大利的考古學家計劃對墓室中的遺骨進行DNA檢測，如果能確定蓋拉爾迪尼的身份，他們就會憑借頭骨和《蒙娜麗莎》的細節復原這位佛羅倫薩女性的面容。

還有更多的謎團能夠通過墓室內的這副白骨得到解答。不止一個人注意到了蒙娜麗莎笑不露齒的淑女范兒，一位美國醫生說，這笑容看起來那么曖昧，因為那是典型的掉了門牙的笑容；另一位來自丹麥的醫生確信麗莎的右臉先天性麻痹，她那微微腫脹的手即是明證；還有一種更流行的說法指出，因為正在進行梅毒治療，她的牙齒變成了黑色，所以不得不緊閉雙唇。

“依據當前的醫學技術，我們可以復原出她的身體特征，并重現那個為人熟知的姿態。”一位達芬奇專家這樣告訴英國《每日郵報》。

科技能夠為我們還原510多年前的那一刻——大約在1502或是1503年，綢緞商的妻子蓋拉爾迪尼坐到了達芬奇的畫板前。她那時很可能懷有身孕。也許為了紀念新生命的誕生，也許是慶祝全家人即將喬遷新居，綢緞商找到了老朋友達芬奇，讓他為妻子畫一幅像。

然而，恐怕再熟悉史料的學者都說不清，這一次考古發掘之后，他們所接近的，是畫中神秘笑容的主人，還是另一個關于這幅古畫的不解之謎。

唯有蒙娜麗莎，端坐于盧浮宮永遠擁擠的欄桿后，經年不改那一絲欲說還休的淺笑。